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No debería pasar porque en realidad el móvil está funcionando y por tanto no está en suspensión, ya que el gestor de descargas está activo.
Pero si vieras que te ocurre y necesitas que una descarga que dure digamos 10 minutos o más se termine yo veo mejor dejarlo enchufado ese rato para que no se corte que tener el wifi siempre activo. O poner el ajuste en activo siempre solo para esas descargas más largas. No recuerdo que me haya pasado pero dudo que en una descarga de 5 minutos llegue a ocurrir.
De todos modos son recomendaciones que he seguido siempre y en comparación con otras gente siempre he tenido los mejores consumos de batería, ya es cuestión de las necesidades de cada uno.