Buenas frandc
Es totalmente imposible saber que es lo que has realizado y como tienes configurado todo, con lo que poco podemos ayudarte.
Para empezar, no tengo la menor idea del motivo por el cual has puesto un Switch después de la ONT, ya que todo el tráfico sale de la ONT completo, con lo que cualquier Router propio que se quiera colocar le llega todo, las 3 VLAN del servicio, para que el Router propio cree sin problema 3 interfaces WAN independientes, cada una según su etiquetado VLAN
Efectivamente, en lo tocante a la configuración de la interfaz WAN para VoIP, solo requiere dos cosillas: Un cliente DHCP en automático, y escuchar las rutas por RIP como es natural.
Con eso simplemente, tendría que funcionar sin problema alguno, aunque a veces, dependiendo del Router y otras cuestiones, puede ser necesario que el Router use un ayudante SIP (passthrough)
Y creo que no me dejo nada...